Необходимость указания отца в документах ребенка, даже если оно вымышленное - объяснение ситуации.
Во всех документах .анкетах и автобиографиях ваш сын обязан писать такое имя и фамилию отца, которое указано у него в свидетельстве о рождении и которое дали ему вы по ст.48 СК РФ . А вымышленное оно или нет -вообще никого и никогда не должно волновать . И в "базе" его тоже никто искать не будет.
Вы создали себе проблему на ровном месте.
.
Приказ Минобороны от 02 октября 2007 года №400
Приложение №32 к Иструкции
Перечень документов, подтверждающих наличие у гражданина основания для освобождения его от исполнения воинской обязанности, от призыва на военную службу...
п.2. При рассмотрении вопроса о предоставлении гражданину отсрочки от призыва на военную службу призывной комиссии предоставляются подлинники следующих документов:
б) занятому постоянным уходом за отцом, матерью, женой... если отсутствуют другие лица, обязанные по закону содержать указанных граждан...
св-во о рождении гражданина, подлежащего призыву на военную службу;
справка о составе семьи ...