Каковы причины возникновения запрета при пересечении границы России, несмотря на отсутствие ограничений в ФМС?

Я гражданин Азербайджанской республики, обучаюсь в Российском высшем заведении, имею ВНЖ, на сайте ФМС запретов нету, но при пересечении российской границы сказали, что у меня стоит запрет. Это было аж в 2013 году, но я уже выезжал, тогда у меня не было запрета, а сейчас он есть, такое возможно?