Как минимизировать санкции со стороны УФМС при расторжении трудового договора с переселенцем из Луганска, у которого было разрешение на работу?

Мы предприятие субъект малого бизнеса. В декабре 2014 года приняли на работу гражданина-переселенца из Луганска. Оформили официально, на основании нашего трудового договора он оформил разрешение на работу с указанием нашей организации как работодателя. Разрешение было дано до 05.07.2015 г. Сейчас после окончания срока разрешения он оформляет патент. Соответственно мы старый договор с ним расторгаем, и заключаем новый. При завершении старого трудового договора обнаружилось, что кадровик не уведомил УФМС; ИФНС. Стоит ли теперь уведомлять УФМС о расторжении? Как минимизировать санкции со стороны УФМС, с учетом, что сотрудник был принят официально, имел разрешение на работу, временную регенерацию, с его зарплаты полностью платились все налоги, и взносы в фонды?