При досрочном увольнении (ранее 5 лет), сотрудник обязуется выплатить затраты фирмы на обучение: зар.
Все отношения по обучению работника регулируются отдельным договором на обучение, подписанным работником и работодателем. Именно в этом договоре и должны оговариваться сумма обучения, срок отработки, порядок компенсации в случае увольнения. В любом случае сумма компенсации должна быть пропорционально отработанному времени. При чем договор на обучение должен быть подписан до начала обучения, а не после, т.к. это дает возможность работнику отказаться от обучения, если условия по договору кабальные.
При отсутствии такого договора Вы можете смело отказываться что-либо отрабатывать или компенсировать.
Настоятельно советую не подписывать дополнение, которое предложил Ваш руководитель. Тем более что Вы имеете на это право.
Дело в том, что все что Вы подпишите будет иметь юридическую силу (Вы дали свое добровольное согласие - насилие над Вами никто не совершал), и в дальнейшем (если Вы будете обучаться) работодатель будет делать ссылку именно на п.3.6. трудового договора, как на пункт регулирующий вопросы по обучению. Если Вы уверены, что точно обучаться не будете - тогда подписывайте.