Как решить проблему с упрощенной системой налогообложения или ЕНВД после оформления ИП в сфере грузоперевозок без НДС?

Оформили ИП,но не написали заявление о переходе на упрощенную систему налогообложения или ЕНВД. Работаем в сфере грузоперевозок (1 машина). Нам сказали в налоговой, что работаем по общим основаниям--работаем с НДС. А мы думали все время, что работаем без НДС. Все счета и акты отправляли без НДС. Что теперь делать?