Здравствуйте. Задолженность в пенсионном фонде не препятствует закрытию ИП. Берёте справку о задолженности, заполняете заявление на закрытие ИП, заполняете нулевую отчётность, оплачиваете госпошлину. Через 5 дней получаете выписку и желательно сообщаете в пенсионный фонд.