Подрался сотрудник на работе и попал в больницу - каковы последствия для всех, включая генерального директора?

Нет для руководства последствий. Потерпевший вправе обратиться в полицию и привлечь виновника к ответственности.

на первый взгляд для ген. директора последствий никаких. потерпевший вправе подать заявление Мировому судье о привлечении виновного к уголовной ответственности, например, по ст. 116 УК РФ Побои или по другой статье в зависимости от степени тяжести вреда здоровью (подсудность может измениться).