Как закрыть ООО с очень большим долгом по подотчету?

Подотчет это не кредиторская задолженность. Поэтому ликвидация возможна по общему правилу. Т.е. принятие решения о ликвидации, создание ликвидационной комиссии и т.д. Процесс этот длительный. Есть способы ликвидации в результате реорганизации предприятия.