Имею 5/8 долей автомобиля, связь со вторым наследником отсутствует, судьба его не известна. Можно ли продать автомобиль?

НЕТ конечно.

Можно продать автомобиль но только кто его купит на учёт поставить можно только согласие всех собственников

Здравствуйте. Наследство оформлено, он вступил? Если вступил то так и найти, - по сведениям нотариуса. В "идеале" конечно вам оформить бы и исключить его из собственников. Зависит от документов как это сделать. Хотя договор купли продажи простая письменная форма. Если он не будет обжаловать то..... Постарайтесь найти через нотариуса и выкупить его долю. Если он ваш родственник можете обратится в полицию , проведут проверку, потом обратитесь в суд с заявлением о признании без вести пропавшем и затем сможете забрать его долю у его правопреемником. Вариантом много. Нужно решать по ситуации.