Как поступить, если прошло более 3 лет с момента выдачи судебного приказа по алиментам?

Не нужно. Предъявляйте приказ приставам.

Данный судебный приказ действует до совершеннолетия ребенка, поэтому просто предъявите его в службу судебных приставов по месту жительства должника.