После зимней сессии не сдан один зачёт, его перенесли на июнь, это не противоречит ничему?

Все положения касающиеся промежуточной аттестации обучающегося закреплены в Уставе ВУЗа и в разработанном на его основании Положении о текущем контроле успеваемости и промежуточной аттестации обучающихся. Если возможность переноса зачета там указана - то перенесли правомерно.