Как получить согласие собственников мкд на пристройку балкона к квартире при их отсутствии

Только общим собранием, по другому ни как.

Инициируйте общее собрание собственников с повесткой дня Вашего вопроса.

Вам не нужно согласие всех собственников, а нужно протокольное решение простым большинством (соблюсти кворум) голосов общего собрания МкД.