Должна ли оплачивать за вывоз мусора в деревне где прописана, не живу там 15 лет.

Нет не должный. Обратитесь с заявлением о перерасчете начислений в компанию по вывозу мусора и приложите к нему подтверждающие документы (конкретных требований к документам нет), это может быть, справка о регистрации по месту временного пребывания в указанный период, договор найма жилого помещения и т.д. все что может подтвердить Ваше отсутствие по месту регистрации в указанный период для перерасчета.