Может ли ответчик, перечислять задолженность по иным реквизитам, или только по тем что указаны в исполнительном производстве?

По тем, что указаны в реквизитах.

Предполагаю, что хотите напрямую заплатить взыскателю. Так можно, но надо обязательно уведомить судебного пристава-исполнителя. И это не освободит вас от уплаты исполнительского сбора (если уже просрочили)