Что делать, если твой сын приглашен в суд как обвиняемый за отсутствие маски?

Он не обвиняемый, а правонарушитель. Его привлекут к административной ответственности и оштрафуют.

Дела, предусмотренные чт. 20.6.1 КоАП РФ рассматриваются в суде и наказание назначает только суд, а не полиция. Если составлен протокол, то это дело обязательно направляют в суд. А какое наказание - предупреждение или штраф, будет решать суд. Только он не обвиняемый, а лицо совершившее административное правонарушение.

Наказание сыну определит суд в пределах санкции вменяемой Вам статьи КоАП РФ, с учётом всех обстоятельств, заслуживающих внимания.

Сыну следует явиться в суд и дать свои пояснения по существу нарушения.