Добрый вечер Виктор!
Основанием для увольнения является состояние здоровья - в связи с признанием военно-врачебной комиссией не годным к военной службе.
Это означает, что военослужащий был уволен с военной службы по состоянию здоровья - в связи с признанием его военно-врачебной комиссией не годным к военной службе.