Совершенно понятно, что работники предприятия, которые готовили иск
Здравствуйте Нина.
Недостачу, если она не подтверждена документами, можно оспорить. Иск о взыскании зарплаты и прочей задолженности может быть предъявлен в рамках того же дела, которое рассматривается по иску предприятия. В случае, если Вы выиграете дело, то Ваш проезд будет Вам компенсирован за счет проигравшей стороны. На одно заседание Вам необходимо наверное съездить и оставить заявление о ведении дела через представителя без Вашего личного пристуствия.
Писать протест прокурору - это не предусмотрено действующим законодательством РФ. Можно написать заявление в прокуратуру с изложениями предвзятости судьи, и об участии прокурора в деле по взысканию зарплаты, но скорее всего это ничего не даст.
В Вашем случае объяснения для судьи лучше оставлять в письменной форме и заявлять ходатайство об их приобщении к материалам дела. А то что судья не вникает и не слушает - на это есть апеляция, кассация и т.д.
адвокат Мамонтов А. В.