Я как ип на енвд выдавала беспроцентный займ ООО. Деньги возвращали на расчетный счет. Я могла это делать?

Конечно, Вы могли это делать. Данный вид договора не противоречит законодательству РФ. Может быть Вашему контрагенту по бизнесу понадобились деньги и он обратился к Вам, индивидуальному предпринимателю взять взаймы денег на развитие бизнеса.