Собственник. Я собственник половины квартиры, почему я не могу прописать без согласия

Потому что распоряжение долевой собственностью производится по соглашению собственников, а при отчуждении таких ограничений нет.

Ст.246 ГК -

1. Распоряжение имуществом, находящимся в долевой собственности, осуществляется по соглашению всех ее участников.

2. Участник долевой собственности вправе по своему усмотрению продать, подарить, завещать, отдать в залог свою долю либо распорядиться ею иным образом с соблюдением при ее возмездном отчуждении правил, предусмотренных статьей 250 настоящего Кодекса.

Решением проблемы может являться выдел доли в натуре и перевод жилья в коммунальное. В таком случае проблем с регистрацией не будет.