Какой орган принимает решение обязать ПФ РФ пересчитать начисленные обязательные взносы в связи со сдачей деклараций?

Вышестоящее отделение ПФР.

Например, на районное отделение - городсское, на городсткое - областное и т.д.

Попробуйте обратиться непосредственно в свое отделение ПФР с заявлением о перерасчете страховых взносов.

В рамках закона - единственный. Это суд, только его решения, в рамках действующего законодательства, могут исполняться принудительно, в случае необходимости.