Патент - это разрешения на трудовую деятельность на территории РФ. Этот документ никак не влияет на тот факт, что вы нарушили режим пребывания в РФ. Вам грозит штраф и административное выдворение.
Если вы желаете еще работать в РФ, и если не истпек срок, то можете обжаловать постановление суда о выдворении в Мосгорсуд. Есть варианты для дальнейшего проживания на территории РФ, даже при решении суда о выдворении.