Здравствуйте Наиль.
Если в границах вашего земельного участка расположен пруд, то он в силу закона принадлежит Вам на том же праве, что и земельный участок на котором он расположен (ч.2 ст.8 Водного кодекса РФ), поэтому какая либо дополнительная регистрация на данный объект не требуется.
Что касается гидротехнического сооружения (ГТС) в границах предоставленного Вам земельного участка, отвечу следующим образом, а вы подумаете надо оно вам или нет.
Первое: земельные участки расположенные под объектами гидротехнических сооружений ограничены в обороте (пп.10 п.5 ст.27 Земельного кодекса РФ).
Второе: Земельные участки, отнесенные к землям, ограниченным в обороте, не предоставляются в частную собственность (п.2 ст.27 Земельного кодекса РФ).
То есть если в границах предоставленного Вам земельного участка расположено ГТС, то это ошибка органа предоставившего Вам в собственность земельный участок. Если не хотите, что бы администрация исправила данную ошибку в ближайшее время, то не стоит пытаться оформить права на ГТС.
Всего Вам хорошего.