Могут ли после 12 часовой ночной смены не принимать смену пересменка, если наша смена работала в режиме Аварийной ситуации?

Нет, не могут. Если у вас не принимают смену, имеете право уйти с работы, поставив в известность свое начальство (желательно в письменном виде). Для принятия смены Аварийная ситуация значения не имеет. Если бы Вы вышли на работу непосредственно для устранения аварии (по приказу), вы не имели бы права уйти с работы до устранения аварии. Если вас оставляют на работе после ночной смены, тогда должны производить двойную оплату за отработанные сверх смены часы.