Оформление документального принятия работ после переделки и проведение экспертизы качества при устранении недостатков - вопросы и рекомендации

Со строительной фирмой заключен договор подряда. Выполненные работы приняты, в течение гарантийного срока обнаружены недостатки. Подали иск в суд, назначили строительную экспертизу, по результатам которой установлено, что дефекты являются производственными. В уточнениях иска прописали все согласно заключению эксперта. Вопрос, как оформить документально принятие работ уже после переделки? Надо ли проводить экспертизу качества при устранении недостатков выявленных работ?