Но не понятно-и вот 28 июля меня выписали из больницы, я пошел и купил билет на поез в Мурманск на 31 июля.

Вы же не пишите о том, что находились в больнице не по месту жительства, поэтому ответ именно такой.

Если у вас нормальный работодатель, то ничего необычного произойти не должно, просто первый день вашего выхода на работу после отпуска и нетрудоспособности должен быть последним рабочим днем.

Все эти дни отсутствия будут днями отпуска, получите меньшую компенсацию. Действительно, не могли же вы заранее знать когда выздоровеете, и имеются ли на это время билеты на обратную дорогу.