Выход на неполный рабочий день и оформление повышения оклада во время текущего отпуска по уходу за ребенком до 3 лет не окажут негативного влияния на будущие декретные выплаты. Напротив, эти меры могут улучшить ваше материальное положение.

Да не факт что вам его повысят, это первое, и второе как видно из вопроса, вас нет в данной организации, вы можете находиться за штатом, до исполнения 3 лет ребёнку. Других выплат вы не получите из новой организации, если вас в неё не перевели, или не приняли.