смотря по какой причине не совпадает.

т.е что произошло.

какого-то универсального способа постановки на учет нет.

Автомобиль Вы можете поставить на учет если не совпадает номер двигателя с ПТС, самое главное чтобы совпадала модель двигателя, указанная в ПТС и номер двигателя должен обязательно читаться.

Скорее нет, проверит инспектор и отправит на экспертизу или вручит отказ в регистрации

непонятно.. зачем вы его покупали???

вполне вероятно- в угоне