Алименты взыскивают с дохода после того, как удержат из него налоги в соответствии с налоговым законодательством.

Налоговый вычет уменьшает налоговую базу по НДФЛ. В результате этого доход, из которого удерживаются алименты, увеличивается. Соответственно, с полученного налогового вычета нужно заплатить алименты.