Нет, не вправе.

Запрещено в условия трудового договора (и НПА тоже) включать условия ухужшающие положения работников ст. 57 и 8 ТК РФ

, а эти услвия ухудшают, по скольку в ТК есть иное определение прогула, оно дано в ст 81 ТК РФ:

а) прогула, то есть отсутствия на рабочем месте без уважительных причин в течение всего рабочего дня (смены), независимо от его (ее) продолжительности, а также в случае отсутствия на рабочем месте без уважительных причин более четырех часов подряд в течение рабочего дня (смены);