Вы можете выбрать любой из этих способов. Все зависит от того насколько вы готовы отстаивать свои права. Ведь вполне может случиться так что дело закончится судебным разбирательством. Что решит суд сказать сложно. Но так как п.7 ст. 3 НК РФ гласит "Все неустранимые сомнения, противоречия и неясности актов законодательства о налогах и сборах толкуются в пользу налогоплательщика (плательщика сбора, плательщика страховых взносов, налогового агента)", а тут "сомнения" налицо, я бы выбрала первый из способов. Но если вы боитесь что дело может дойти до суда, попробуйте проконсультироваться в налоговой инспекции или у практикующего по таким вопросам юриста в вашем городе. Всего хорошего!