Вы откуда эти сроки взяли? И Постановление надо обжаловать

По административным делам в отличие от гражданских расходы потерпевшего, связанные с рассмотрением дела взыскиваются как убытки в порядке искового производства. Иск можно подавать в течение срока исковой давности (три года), а не три месяца как это установлено ГПК РФ для судебных расходов по гражданским делам. Для возмещения транспортных расходов кроме чеков на покупку бензина нужны документы на машину, сведения о расходе топлива на 100 км пути, сведения о километраже при поездках и расчёт взыскиваемой суммы. Эти расходы должен возместить виновный, а не государство. За счёт бюджета возмещаются расходы потерпевшим по уголовным делам, а не по административным. Решение судьи об отказе в возмещении транспортных расходов можно обжаловать в течение месяца после изготовления в мотивированной форме в вышестоящий суд. Для мирового судьи это районный суд, для районного - областной. Если срок обжалования пропущен из-за позднего получения копии решения, в апелляционной жалобе нужно ходатайствовать о его восстановлении.

А откуда Вы вообще взяли эти 3 месяца, в КоАП РФ нет никаких временных ограничений по взысканию издержек. Обращайтесь с заявлением к судье, рассмотревшем дело в порядке ст.ст.24.7, 25.14 КоАП РФ